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第一話.憤怒的瞳孔
C.E.71年6月15日
位於太平洋赤道的中立國家歐普聯合首長國遭到地球聯合軍的入侵，歐普首長烏茲米、由拉、阿斯哈為了貫徹和平的理念，與女兒卡佳里、由拉、阿斯哈及其弟煌、大和鎮守歐普。淤能碁呂島在地球軍的三架新型鋼彈與自由鋼彈的火拼之下滿目瘡痍。平民調整者真、飛鳥一家在這戰火破壞中努力想逃進難民船中。而在自由鋼彈的五門砲之下，家人在真面前慘死，血紅的瞳孔留下了憤怒的淚水、悲慟的嗚噎在戰鬥中徘徊著。
C.E.73年10月2日
地球的地球聯合軍與殖民地的札夫特軍在最後的亞金、杜威戰役之後，在曾經是調整者的悲劇之地『由尼烏斯七號』，達成了和平協議。歐普現任首長卡佳里與侍從阿歷克斯、迪路為了解決歐普在戰亂時，流失到殖民地的人力技術而來到了殖民地，而今日，正是札夫特新型宇宙艦智慧女神號的首航日。在一處，地球軍的幾名諜報人員深入一地，殺了許多作業員與士兵之後，其中三人坐上了三架MS。卡佳里在與殖民地現今最高議長杜蘭朵談話之中，發生了一起爆炸聲，在灰色的煙霧之中，聳立的是札夫特軍三架新型鋼彈─混沌鋼彈、大地鋼彈、深淵鋼彈。在突如其來的混亂之下，三架鋼彈到處破壞這個屬於軍事工廠的殖民地，即使有能夠啟動的MS也旋即被殲滅，卡佳里跟阿歷克斯只能緊急避難，面對到處都是一片滿目瘡痍的情況中，阿歷克斯只能開動了殖民地的MS薩克來保護首長，然而遭受到了三架鋼彈的圍攻，阿歷克斯也難以招架，就在緊急之時，一架戰機飛過天際，並且與三個組件組成一架MS，裡面的戰鬥駕駛正是那位曾經是歐普平民的真、飛鳥。
第二話.喚來戰爭之物
昔日的歐普平民真、飛鳥，現今成為札夫特軍的紅衣軍人─精英戰鬥駕駛，座機更是搭配智慧女神號的專屬鋼彈─脈衝鋼彈，其最大特色就是只要核心戰機沒有損毀，其身體組件、腿部組件，以及武器組件─綠色的砲擊系統、紅色的劍鬥系統以及藍色的飛影系統可以任意替換，更換其配件就是智慧女神號的獨有專利，在真與阿歷克斯的力戰之下，勉強抵擋三架鋼彈的攻擊。殖民地外，巡迴警戒的兩艘納斯卡級戰艦被地球特派艦擊沉，殖民地宇宙港更是被侵入的兩架地球軍MS破壞，使得地球軍可以以逸代勞的準備接應三架鋼彈，主導的地球軍神秘蒙面上校及其開出的伊格薩斯戰機，戰鬥的英姿跟其身影像極了某個早已不在世上的人物。殖民地內，與真同期的紅衣軍人雷、薩、巴勒路與露娜瑪麗亞、霍克總算開動了薩克魅影與薩克戰士迎擊入侵者，兩架鋼彈看苗頭不對準備撤退，駕駛大地鋼彈的史黛拉、路歇爾因被激怒而不斷反擊，駕駛深淵鋼彈的奧爾、尼德丟了一句"難道你想死嗎？"給史黛拉，聽到"死"這個字的史黛拉性情大變，逃也似的離開戰場，駕駛混沌鋼彈的史汀格、歐格雷則責備了奧爾。真與雷開始追擊打破殖民地外殼逃出的三架鋼彈，露娜瑪麗亞的座機故障而先行返艦，而阿歷克斯因為卡佳里受了傷而先行尋找議長到了智慧女神號裡面。在與智慧女神號的船員交涉當中，聽到了智慧女神號要出擊的消息，卡佳里不小心脫口叫了阿歷克斯一句"阿斯蘭"而引起露娜瑪麗亞的一陣驚疑。
第三話.預料的戰火
追擊三架鋼彈的真與雷，與尼歐上校交了手，尼歐與雷之間，彷彿有一種特殊的聯繫，使得彼此感應的到對方的存在。在與似乎身���百戰的尼歐的四個線筒型操控光束砲面前，真與雷被逼停下了腳步，智慧女神號則追了上來，要求真與雷歸艦，被札夫特稱之為"不明艦一"的地球軍戰艦，正被智慧女神號咬住尾巴不斷追擊，尼歐巧妙利用了推進器脫離擋住了智慧女神號擺脫了追擊。被智慧女神號迎為上賓的卡佳里與阿歷克斯，正跟著一起避難到船上的杜蘭朵議長參觀艦上設施，由於杜蘭朵議長不斷介紹著新型裝備，使得卡佳里對札夫特興師問罪了起來，認為今天殖民地的混亂又都是擁有過度力量所帶來的紛爭，而在此時，真則大聲怒吼了，"說好聽話真不塊是阿斯哈家的傳家本領啊"。雷緊急制止真的說話，杜蘭朵則跟卡佳里說了一句他曾經是歐普的市民，使得卡佳里一陣錯愕。不明艦一中，搶奪到鋼彈的三名戰鬥駕駛正沉睡在某個神秘的裝置中。智慧女神號終於捕捉到了不明艦一的身影開始出擊，卡佳里與阿歷克斯被迎到艦橋中，此時，早已看出阿歷克斯真實身分的議長開口叫了他一聲─阿斯蘭、薩拉。
第四話.星塵的戰場
被看出身分的阿斯蘭繼續不動身色，真與露娜瑪麗亞開始迎擊三架鋼彈，在5架MS的纏戰當中，智慧女神號掉進了不明艦一所設下的圈套，雷緊急出動，感應到了雷的尼歐也開出伊格薩斯與其纏鬥，智慧女神號被不明艦一強力追擊趨於劣勢，在危機之刻，阿斯蘭提出的戰略幫助智慧女神號扭轉劣勢，使得地球軍只得撤退。戰鬥後，三名戰鬥駕駛與露娜瑪麗亞的妹妹、負責密涅瓦的戰鬥管制CIC─美鈴、霍克一邊閒聊著關於阿斯蘭的事一邊到了休息室，在札夫特中關於阿斯蘭的傳說，就是前薩拉議長之子、以及在亞金、杜威戰役中駕駛正義鋼彈縱橫沙場的王牌機師，而剛好在休息室中的阿斯蘭剛好全聽了進去，見到阿斯蘭的露娜瑪麗亞跟阿斯蘭婀娜了他幾句，阿斯蘭則說自己是阿歷克斯，不是阿斯蘭，真見狀說了一句，"呆在歐普的傢伙什麼都不明白"。此時，殖民地偵測到了由尼烏斯七號往地球方向移動的消息。
第五話.無法癒和的傷痕
偵測到由尼烏斯七號往地球方向移動的消息很快的傳到了智慧女神號，與塔麗亞、葛拉蒂絲艦長在一起的杜蘭朵議長則迅速的下達了智慧女神號前往執行破壞任務。智慧女神號的成員當中，有些人對於由尼烏斯七號即將對於地球產生的巨大破壞不以為然，使得卡佳里非常憤怒，質問著他們究竟是不是真的想要和平，真則再度發怒的說，"堅持著自己的正義、究竟會害別人失去多少東西"，卡佳里被曾經是歐普市民的真罵的啞口無言。地球某處，聚集著一群人，似乎對於由尼烏斯七號是某種"導火線"而開始商議著某件陰謀，帶頭的人甚至還說出了"為了蔚藍純淨的宇宙而戰"這句名詞。卡佳里受到了真的委屈之後，向阿斯蘭吐露自己的痛苦，阿斯蘭則說了妳並沒有錯來撫慰卡佳里入眠。另一支札夫特的破壞隊伍也開到了由尼烏斯七號附近，領隊的正是穿上白色隊長服的伊薩克、焦耳，以及被降為綠服的迪安卡、艾斯曼，正當破壞任務執行之時，出現了大量札夫特MS基恩部隊干擾破壞任務，收到訊息的智慧女神號，在阿斯蘭要求使用MS而議長欣然允諾的情況下，開向了混亂的戰場，而有如芒刺在背般的不明艦一，也跟隨而入。
第六話.世界結束之刻
地球方面，得知了由尼烏斯七號即將落下的消息而發布了緊急避難命令，在一處冷眼看待的正是之前聚會的帶領人，吉普立爾。戰場中，不清楚狀況而插手的不明艦一部隊、神秘的基恩部隊、焦耳隊與智慧女神號部隊爆發了大混戰。之間，焦耳小隊終於成功的分裂了大半部分殘骸，但仍有一半往地球墜落，與老戰友重逢的阿斯蘭、伊薩克、迪安卡強勢壓制了基恩部隊與混沌鋼彈，其實力之堅強也讓真吃驚。不明艦一在接近空降臨界點似乎終於理解情況，三架鋼彈返航，焦耳隊也一樣。智慧女神號決定要空降地球，並且途中以陽離子破城砲繼續摧毀殘骸。仍繼續破壞殘骸的真與阿斯蘭，在基恩部隊的攻擊下遲遲無法返航，阿斯蘭與基恩的交手中，聽到了對方的意圖，"像現在這種虛偽的和平，要由我女兒的這座墳墓來證明"，這幾句話讓阿斯蘭錯愕不已，想起了主張調整者為新種族的父親，以及同樣葬身與此的母親。在基恩的拖延之下，阿斯蘭與真無法歸艦，只能直接降落地球，而智慧女神號終究無法完全破壞由尼烏斯七號。地球上，拉克絲、克萊因正帶領著一群小孩子避難，在海岸邊看著巨大火球落入大氣層的身影，是煌。
第七話.混亂的大地
在拉克絲撫平小孩子的歌聲中，巴黎、上海及希臘等世界各地遭到了墜落的由尼烏斯七號的嚴重破壞，流離失所與死傷的人數無法估計。真與阿斯蘭總算好不容易突破大氣層與智慧女神號會合，卡佳里對於歸來的阿斯蘭表達感謝之意，很高興他能減少地球的災情，真又很不高興的說了他的聽聞，說這次的犯人是調整者、是一群派屈克、薩拉的支持者，阿斯蘭則顯得很消沉。早在宇宙先行返回殖民地的議長則發表了緊急談話，並且給予地球莫大的援助。但是卻在"藍色波斯菊"的情報操作之下，基恩在由尼烏斯七號上的活動被公開，帶給地球一片騷動。阿斯蘭在真他們的槍隻訓練中，顯示了不凡的身手，真問了他，"像你這麼有實力的人，為什麼要呆在歐普？"。
第八話.命運的交叉點
在卡佳里的建議下，智慧女神號開往了歐普，前來接艦的一行人中，一位羅馬家的由拿，他對阿斯蘭冷嘲熱諷的將卡佳里拉走，讓阿斯蘭感到不悅。替智慧女神號維修管理的是化名為瑪麗亞、貝魯尼斯的前地球軍大天使號艦長瑪琉、雷明斯，兩名艦長有了短短的談話。市政府中，很明顯的以羅馬家主張與地球軍同流的親地球派佔了上風，使卡佳里形同傀儡。阿斯蘭與煌談了話，覺得在戰爭之後並沒有找到自己的答案。隔日，阿斯蘭決定要前往殖民地盡一份心力，將歐普交給卡佳里，並且在臨走之時，給了她定情的禮物。傍晚，重返故地的真，在海岸邊走到了一塊開滿花的慰靈碑，碰到了也是第一次到此地的煌，面對不認識的煌，真說了一句，"不管花開的怎麼漂亮，人們總會忘記"。另一邊，歐普行政府中，地球軍傳來了與上次交戰中相同的牒文。
第九話.傲慢的獠牙
卡佳里面對地球人民共同的憤怒，顯得不知所措。在飽受創傷的大地上，米蕾莉亞、哈烏正身為記者拍照記錄著。面對地球軍的進逼，殖民地也下達了紅色警戒，就在此時，地球軍居然以核彈向殖民地進行突襲，負責防守的伊薩克嚇了一大跳，幸虧殖民地早有預防，以新型磁共振設備化解了危機，聽到此消息的幕後黑手吉普立爾非常躁怒。回到了殖民地的阿斯蘭正在等著與議長談話，但出現在他面前的，居然是應該待在歐普的拉克絲。
第十話.父親的咒縛
阿斯蘭接見了議長之後，聽到了戰爭的消息非常驚訝���但是對於出現在殖民地安撫民眾的假拉克絲表達懷疑，但議長卻說他需要她的力量，就像需要阿斯蘭的力量一樣。其後，議長帶領他前往看查要贈予他的座機─救星鋼彈，說要有力量，才能保護重要的事物。晚上，阿斯蘭與假拉克絲─米亞、坎貝爾共進晚餐，阿斯蘭詢問米亞的意思，米亞說，她想要為殖民地盡一份心，代替不在的拉克絲，她也能做一些事，此些話，給阿斯蘭帶來很大的動搖。
第十一話.選擇的道路
議長以"行使自衛權"為由，進行大量增援地球札夫特軍隊的方案。與迪安卡一起被調往接洽阿斯蘭的伊薩克見到阿斯蘭就非常不高興，說是要戰爭了居然給他閒差，但是卻跟迪安卡一樣很高興見到老朋友，三人前往掃尼可的墓時，伊薩克跟阿斯蘭說了議長給他們的幫助，並要求阿斯蘭回到札夫特。此時的歐普，飽受壓力的卡佳里被逼與地球軍結了盟，真見狀又非常不悅，丟了一句，"這次就由我來消滅這個國家"，完全忘了自己跟卡佳里說過的遭遇。同時間，也是住在歐普的沙漠之虎─安迪、渥特菲德緊急給了智慧女神號快點離港的訊息。
第十二話.被血染紅的大海
緊急離港的智慧女神號，被埋伏的地球軍偷襲，面對數量龐大的地球軍，智慧女神號也被已在歐普領海戒備的歐普軍艦逼的退無可退，遇到了這樣的危機，在地球軍新型MA的強力攻擊下，智慧女神號岌岌可危，此時，在忍無可忍的情況下，憤怒到極點的真，達到了精神爆發的臨界點，以一人之力，掃平了地球軍艦隊。在殖民地，阿斯蘭接受了札夫特軍人最高榮譽"忠誠者"的徽章，並開啟救星鋼彈前往地球。
第十三話.復活的羽翼
面對真的活躍，智慧女神號一片歡騰，副艦長亞瑟、特萊恩說了一句議長真不塊是破解DNA的專家，塔麗亞也說終於明白為什麼脈衝鋼彈是交給真而不是雷。此時的卡佳里，被親地球派的由拿逼婚。在馬爾奇歐導師的家中，安迪、瑪琉、拉克絲、煌與其母雁田和一群孤兒生活著，某晚，一群調整者的武裝部隊潛入暗殺，目標很明顯是拉克絲。眾人逃進防空洞之後又被MS阿修攻擊。在安迪的勸告下，拉克絲打開了艙門，站在煌面前的，正是維修好的自由鋼彈。其後，煌以大魔王之姿，掃平了MS，而MS部隊則以自爆來做尾聲。
第十四話.朝明日起航
煌等人在天亮後，收到了卡佳里的字條與阿斯蘭給她的定情戒指，說明她為了歐普，決定下嫁由拿並加入地球軍。煌與瑪琉則確定卡佳里做錯了決定，並準備開啟沉睡在歐普海底的大天使號來捍衛和平之路。婚禮舉行的時候，自由鋼彈殺入，並將卡佳里綁走。大天使號也在歐普軍官特達軋上校的迴讓下，開出了領海。
第十五話.重返戰場
回到歐普準備與智慧女神號會合的阿斯蘭理所當然遭到歐普軍的攻擊，面對一片未明的情況下的阿斯蘭只能離開歐普。大天使號中，卡佳里正生氣的責備煌做錯了事，煌說了，究竟烏茲米的理念是不是正確的，卡佳里委屈的說她也無計可施了，而煌說很抱歉，從來沒替卡佳里分擔過，不過既然做錯了事，就要趕緊端正回來，卡佳里握著阿斯蘭的戒指痛哭失聲。來到卡貝塔力亞基地的阿斯蘭，聽到卡佳里結婚的消息大驚失色，但聽聞大天使號帶走卡佳里的時候放心不少。此時智慧女神號準備對於地球軍內鬨的歐亞西線做出進擊，霍克姊妹對阿斯蘭興趣大增。另一邊，早已降落地球的尼歐與其部隊也準備開向歐亞西線。
第十六話.印度洋的死鬥
歐亞西線的印度洋有許多不服從地球軍的民眾被當作奴隸使喚，因此內鬨不斷。智慧女神號與一艘潛艦前往進擊，尼歐也前往迎擊，在纏鬥中，札夫特軍除了對付水中專用機深淵鋼彈較吃力外，阿斯蘭的救星鋼彈與真的脈衝鋼彈卻壓制了尼歐的閃耀與史汀格的混沌鋼彈，並擊落許多地球軍MS，深淵鋼彈卻也將扎夫特潛艦擊沉，真與大地鋼彈展開格鬥戰。在損失殆盡的情況下，尼歐下達了撤退命令。眼見地球軍的不仁道行徑後，真憤怒的破壞了許多設施，並幫居民相聚。其後，阿斯蘭賞了他兩巴掌，跟他說，"戰爭不是英雄行徑，有力量的人要為自己的力量負責"。
第十六點五話.EDITED
總結
第十七話.戰士的條件
在大天使號中，由於米亞在螢光幕上的表現，即使議長風評在好，經歷暗殺事件後的煌等人不相信杜蘭朵議長。智慧女神號到了蘇伊士附近的札夫特基地，準備對於鎮壓此處居民騷動的地球軍展開據點攻略。阿斯蘭與真交談了一會，喜歡真直性子的阿斯蘭，要求真好好思考自己力量的去向。
第十八話.討伐羅安格林
駐守在蘇伊士附近的地球軍，由於配給了陽電子破城砲及新型MA，使得札夫特軍屢戰不下，此時當地被壓迫的居民給了札夫特軍相當的情報，讓札夫特軍有了相當的戰略，而真因為跟線民吵了起來則不太高興出擊，卻又被阿斯蘭給趕鴨子上陣。真執行的是高難度的飛行，而且也是最重要的關鍵之一，在真成功的突破防線並摧毀羅安格林砲之後，外線夾擊的阿斯蘭等札夫特軍也成功獲得了勝利。
第十九話.看不見的真實
由於在蘇伊士地方獲得了空前的勝利，因此米亞與議長前來勞軍，阿斯蘭對於許多人發現拉克絲有點不一樣感到不安，而霍克姊妹則纏著他揶揄幾句這麼久沒跟未婚妻見面真可惜。議長與雷之間，似乎有種奇妙的關聯。議長接見智慧女神號的戰鬥駕駛之後，講出了地球軍的內鬨以及未來的信念，使得駕駛員們對他非常推崇。阿斯蘭在私底下問了關於米亞的事，議長只跟他說假使大天使號跟他有聯絡的話，務必跟他講一聲。
第二十話.PAST
真自從大天使號首次進入歐普之後，身邊的事物就開始起了動搖，地球軍在失去約書亞與巴拿馬之後，向歐普挑起了戰火，痛失家人的真，在一名叫做特達軋的歐普軍官幫助之下，移民殖民地並進入札夫特軍校，一直到今天，真永遠都不希望有戰爭，但是只憑信念，什麼都無法保護。
第二十一話.迷惘的雙瞳
露娜瑪麗亞在一大早便邀請阿斯蘭同進早餐，沒想到米亞居然在阿斯蘭房間裡，連阿斯蘭也拿米亞的纏功沒輒。駕駛員們認識了同屬忠誠者的戰鬥駕駛海涅、威斯汀福爾斯，大方沒架子的海涅很快就獲得大家的好感。阿斯蘭之後想對露娜瑪麗亞解釋米亞的事也是百口莫辯。真在下午外出時，遇上了正在海邊閒晃的史黛拉，史黛拉一不注意就從懸崖掉進海裡，真只能跳下去救她，在驚慌中的史黛拉一直掙扎著，使得真罵了一句想死啊反而引起史黛拉更大的的恐懼，弄傷了真之後的史黛拉嚷著不想死往海邊走去，勾起真痛苦的回憶，用力抱住史黛拉之後說了一句我會保護妳，史黛拉才平靜下來。在海邊洞窟烤火取暖之時，史黛拉不太會說自己的過去，讓真以為她是戰火的犧牲者。阿斯蘭趕到救援之後，史汀格與奧爾也正��尋找史黛拉，兩方人馬有了短暫的會晤。
第二十二話.蒼天之劍
地球軍以尼歐為首的艦隊要奪回黑海，連由拿率領的歐普軍隊也前來助陣，使得真非常憤怒，矢言要將他們全部殲滅。阿斯蘭則要為跟歐普交戰而感到遲疑，海涅則及時點醒他這是戰爭，他們只是軍人。米蕾莉亞也趕到現場進拍照。兩軍開時交戰之初，由於三架鋼彈並未直接投入戰場，真等人依靠主角威能確實壓迫住了聯合軍的MS，智慧女神號為了耗損敵方兵力準備使用陽離子破城砲，就在即將發射之際，自由鋼彈由天而降擊毀了湯豪舍。
第二十三話.戰火的背後
由於大天使號接獲歐普軍出擊的消息，卡佳里便要求航向戰場。現今，在兩軍交手的戰場上，卡佳里要求歐普軍撤退，然而歐普航母劍御雷神號的特達軋上校卻迅速下令攻擊插手的嫣紅攻擊鋼彈，使得卡佳里一陣錯愕，想起了烏茲米所說的話，卡佳里發覺自己犯下天大的錯誤。煌為了保護歐普軍，以及不想看到雙方死傷，便開盡金手指，一看到人就開砲，並且怎麼樣也打不死人，盡顯大魔王姿態，看的阿斯蘭目瞪口呆。尼歐一看到戰況急下，便派出三架鋼彈迎擊，然而卻被煌大魔王通通轟回姥姥家。被激怒的史黛拉，開動大地鋼彈一躍而起，被自由鋼彈打傷的海涅好死不死剛好闖進跳躍線裡，慘遭胸斬。
第二十四話.交錯的視線
痛失夥伴的真等人，怎樣也不認為大天使號是為了和平才來到戰場上的。為了查明大天使號的意圖，阿斯蘭要求前往與大天使號會話，塔麗亞艦長便答應了，但卻派出了露娜瑪麗亞監視。阿斯蘭在尋找大天使號的消息中，碰上了有連絡大天使號方法的米蕾莉亞，米蕾莉亞便幫他連絡了煌與卡佳里。與煌跟卡佳里見了面的阿斯蘭，生氣的責備卡佳里太笨，要她別再做跑到戰場上的傻事，也對煌發了一陣火，說因為他出現了不必要的犧牲，煌則對議長說出不信任的話，並說了拉克絲被暗殺的事情，使得阿斯蘭非常驚訝，對於議長提高了警戒。另一方面，真與雷前往調查地球軍遺留下來的神秘設施，雷到了設施之後表現出一付驚恐的模樣，使得真只能聯絡智慧女神號前往支援。
第二十五話.罪惡的所在
阿斯蘭在與煌談話之後，要求他們回到歐普去掌握政權、擺平條約才是真的，就算手染再多血腥，也無法趕變現況，而煌也說不想再殺人。阿斯蘭在對卡佳里依依不捨之下還是先走了。智慧女神號趕到了真那邊，在設施裡發現了許多屍體，並且調查了之後發現這是地球軍為了對付基因改造後的調整者，以藥物方式製造的強化人生產中心，名單上，清晰可見當年駕駛侵略鋼彈、禁斷鋼彈與瘟神鋼彈的戰鬥駕駛名字。得知了札夫特開始調查設施的地球軍，在談話中被史黛拉聽了進去，當她問起羅德尼亞的實驗室被札夫特軍佔領時，奧爾的反應非常激烈，當說出"媽媽"一詞時，奧爾變得跟聽到"死"一詞的史黛拉一樣慌亂，史黛拉看到了奧爾的反應之後，開啟大地鋼彈前往研究設施。探查到大地鋼彈單機前來的智慧女神號，決定要生擒大地鋼彈，在救星鋼彈與脈衝鋼彈的聯手下，將大地鋼彈的駕駛艙打出了裂痕，真從螢幕上看到裡面的戰鬥駕駛，正是他那天在海邊認識的女孩史黛拉。
第二十六話.約定
發現了史黛拉是大地鋼彈的駕駛員之後，真不顧一切的將史黛拉帶回智慧女神號上治療，因此遭到艦長的責備，調查之後，更發現史黛拉是之前設施的強化人之一，真相令真大為震驚，而被消去記憶的史黛拉，面對真一付凶狠的模樣，使得真非常憂傷。之後，沒接受特殊設備睡眠的史黛拉，恢復了對真的記憶。另一邊，拉克絲決定要回宇宙一趟，在藉機搶了米亞的專機之後，準備回到殖民地，卻被札夫特中途進行攔截，幸虧煌前來護送，才平安無事，在煌的護送下，拉克絲安全的升天。
第二十七話.無法傳達的想法
露娜瑪麗亞將跟蹤阿斯蘭的報告交給塔麗亞，雖然露娜瑪麗亞聽到許多奇怪的事感到懷疑，但也不便完整報告。得知了拉克絲回到宇宙的議長，派遣大量人力進行搜捕。此時，由於沒有接受設備控制的史黛拉逐漸出現了身體不適的症狀，使得真不知所措。而大天使號這，米蕾莉亞重回大天使號擔任CIC。另一方面，歐普與地球聯合軍再度對智慧女神號發動了攻勢。
第二十八話.消逝的性命、留下的性命
當戰端再起時，歐普與地球軍的MS在主角威能的情況下一一被擊落，智慧女神號受到了遠比之前更強大的攻勢襲擊，在千鈞一髮之際，煌大魔王再度登場，而卡佳里則再度出場要求歐普撤退，阿斯蘭被他們嚇的合不攏嘴。當卡佳里開始闡揚沒有理念、軍隊的存在意義為何的時候，真對卡佳里的怨恨到了極限，"妳為什麼只會說漂亮話"，並向嫣紅攻擊鋼彈開火，自由鋼彈見狀向脈衝鋼彈發動攻勢，一擊未中的大魔王非常吃驚，真怒吼著，"你也一樣"，達到了精神爆發的臨界點，跟自由鋼彈纏鬥了起來。歐普軍仍然繼續攻擊智慧女神號，卡佳里見狀想阻止，卻被士兵說的話震住，"現在的歐普最高領導人是由拿、羅馬，我們是軍人，必須聽從長官的命令，由拿、羅馬的意志，就是歐普的意志"，並把卡佳里撞開，繼續向智慧女神號發動攻勢。混沌鋼彈被擊傷返回母艦，露娜瑪麗亞受了重傷、雷的機體被損毀，深淵鋼彈跟脈衝鋼彈纏了上來，阿斯蘭則一直追著自由鋼彈跑。就在此時，憤怒狀態的真將深淵鋼彈擊殺，開始向歐普艦隊進攻，進攻智慧女神號的村雨部隊，以自殺攻擊方法撞上智慧女神號，"以我們的死，來證明歐普的意志"，智慧女神號遭受重創。真像上次在歐普外海掃平地球軍艦隊一般的開始清光歐普軍艦，卡佳里無能為力只能一直哭泣，而煌大魔王則對一直追著自己跑的救星鋼彈不耐煩，說了一句我要向你開槍便將自己的好朋友削成了人棍。真在不知情的情況下，將有恩於自己的特達軋上校劈爆。
第二十九話.FATES
往事歷歷在目，因此才有走向未來的動力。
第三十話.剎那的幻夢
在戰鬥之後，先前被特達軋上校命令離艦的歐普士兵上了大天使號，組成流浪軍
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